cp $DOMAIN/coordinates.nc     $TDIR/DOMAINcfg/.
cp $DOMAIN/bathy_meter.nc     $TDIR/DOMAINcfg/.
cp $GFILE/DOMAIN/namelist_cfg  $TDIR/DOMAINcfg/.
cp $GFILE/DOMAIN/rs.pbs        $TDIR/DOMAINcfg/.
cp $WDIR/make_paths.sh        $TDIR/DOMAINcfg/.

cd $TDIR/DOMAINcfg
qsub  rs.pbs